土地确权登记的具体负责部门因土地类型不同而有所差异。
对于农村集体土地所有权、宅基地使用权、集体建设用地使用权等农村土地的确权登记，一般由自然资源部门负责。自然资源部门掌握着土地的基础数据和空间信息，有专业的技术和人员来开展土地权属调查、测量等工作，以确定土地的归属和范围，并进行登记造册、颁发证书。
而对于国有土地的确权登记，同样也是由自然资源部门承担相关工作。其会对国有土地的使用者进行审查和登记，明确土地使用权益。
另外，在土地确权登记过程中，农业农村部门也会发挥一定作用。比如在农村承包地的确权方面，农业农村部门负责指导农村土地承包合同管理，对承包地的面积、位置等信息进行核实和确认，为自然资源部门的登记工作提供相关依据。
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文章来源参考：头条-土地确权归什么部门管呢，土地确权由哪个部门登记办理内容审核：李佳琦律师
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