在违章建筑征收补偿案件中，法院通常会根据具体情况进行判决。
1.若建筑确实属于违章建筑，且在征收时未依法取得相关建设手续，一般情况下，法院会判决不予补偿。因为违章建筑违反了城乡规划等相关法律法规，不应获得合法的征收补偿。
2.但如果在征收过程中，相关部门未履行法定程序，如未依法进行调查、认定等，导致违章建筑的认定存在瑕疵，法院可能会综合考虑各种因素，判决给予适当的补偿。例如，若建筑虽为违章建筑，但已存在多年且居民已实际使用，法院可能会在一定程度上考虑居民的利益，给予一定的补偿。
3.此外，如果征收补偿方案本身存在不合理之处，例如对违章建筑的补偿标准过低或不合理，法院也可能会根据具体情况进行调整，以保障被征收人的合法权益。但总体而言，违章建筑的认定和补偿问题需要严格依据法律法规和相关政策来确定。
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文章来源参考：头条-，违章建筑征收如何补偿内容审核：刘睿安律师
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