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土地证上使用权面积比实际建筑面积少很多时，应采取以下措施：
1）确认数据差异原因
1. 自行核对：首先，需仔细核对土地证、测量图纸、测量方法等资料，查找是否存在误解或错误，特别注意测量时的坐标系统、测量工具的精度等基础信息。
2. 咨询相关部门：若自行核对无果，应向当地土地管理部门咨询，了解土地确权或登记的具体流程和标准，询问是否存在特殊情况导致面积不符。
2）申请重新测量或补充测量
1. 准备材料：收集能够证明土地实际面积的证据材料，如土地承包合同、土地流转协议、以往土地测量记录、土地使用过程中的相关票据等。
2. 提出申请：向负责土地登记的主管部门提交书面申请，详细说明土地基本情况、面积差异问题及申请重新测量的理由，并附上准备好的证据材料。
3. 配合测量：相关部门受理申请后，会安排专业人员实地测量。在此过程中，应积极配合，提供必要的协助和信息，以确保测量结果的准确性。
3）申请变更登记
1. 提交变更申请：基于重新测量或补充测量的结果，若确实存在面积差异，应向土地管理部门提出变更申请，并提交新的测量报告及相关证明材料。
2. 等待审核与处理：土地管理部门将审核申请材料，若符合要求，会按照实际面积更新土地使用证，完成变更登记。
法律分析：
土地使用证面积，是根据用地审批面积确定的。如果办理的土地使用证面积小于用地批准面积，可以到国土资源局询问，由国土资源局派员实地调查确定后给予答复。
法律依据：
《中华人民共和国土地管理法实施条例》
第四十四条 国家自然资源督察机构根据授权对省、自治区、直辖市人民政府以及国务院确定的城市人民政府下列土地利用和土地管理情况进行督察：
（一）耕地保护情况
（二）土地节约集约利用情况
（三）国土空间规划编制和实施情况
（四）国家有关土地管理重大决策落实情况
（五）土地管理法律、行政法规执行情况
（六）其他土地利用和土地管理情况。
第四十五条 国家自然资源督察机构进行督察时，有权向有关单位和个人了解督察事项有关情况，有关单位和个人应当支持、协助督察机构工作，如实反映情况，并提供有关材料。
第四十六条 被督察的地方人民政府违反土地管理法律、行政法规，或者落实国家有关土地管理重大决策不力的，国家自然资源督察机构可以向被督察的地方人民政府下达督察意见书，地方人民政府应当认真组织整改，并及时报告整改情况
国家自然资源督察机构可以约谈被督察的地方人民政府有关负责人，并可以依法向监察机关、任免机关等有关机关提出追究相关责任人责任的建议。
第四十七条 土地管理监督检查人员应当经过培训，经考核合格，取得行政执法证件后，方可从事土地管理监督检查工作。
第四十八条 自然资源主管部门、农业农村主管部门按照职责分工进行监督检查时，可以采取下列措施：
（一）询问违法案件涉及的单位或者个人
（二）进入被检查单位或者个人涉嫌土地违法的现场进行拍照、摄像
（三）责令当事人停止正在进行的土地违法行为
（四）对涉嫌土地违法的单位或者个人，在调查期间暂停办理与该违法案件相关的土地审批、登记等手续
（五）对可能被转移、销毁、隐匿或者篡改的文件、资料予以封存，责令涉嫌土地违法的单位或者个人在调查期间不得变卖、转移与案件有关的财物
（六）《土地管理法》第六十八条规定的其他监督检查措施。
第四十九条 依照《土地管理法》第七十三条的规定给予处分的，应当按照管理权限由责令作出行政处罚决定或者直接给予行政处罚的上级人民政府自然资源主管部门或者其他任免机关、单位作出。
第五十条 县级以上人民政府自然资源主管部门应当会同有关部门建立信用监管、动态巡查等机制，加强对建设用地供应交易和供后开发利用的监管，对建设用地市场重大失信行为依法实施惩戒，并依法公开相关信息。
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文章来源参考：政府头条-土地使用权面积小怎么办理，土地使用权面积大好还是小好
内容投稿：葛欣
内容审核：杨小燕律师
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