国有土地征收协议是否有效需要根据具体情况进行判断。一般来说，合法的国有土地征收协议是有效的。
1.主体合法：协议双方应当是具有相应民事权利能力和民事行为能力的主体，如政府部门与被征收人等。如果主体不合法，如政府部门超越职权签订协议，可能导致协议无效。
2.程序合法：国有土地征收必须遵循法定的程序，包括征收公告、补偿方案制定与公告、听证等程序。如果程序违法，如未进行公告或未给予被征收人合理的补偿，协议可能被认定无效。
3.内容合法：协议的内容应当符合法律、法规的规定，不得违反国家利益、社会公共利益和他人合法权益。如果协议内容存在违法之处，如约定的补偿标准过低等，协议可能无效。
总之，国有土地征收协议的有效性取决于多个因素，需要综合考虑主体、程序和内容等方面的合法性。如果对国有土地征收协议的有效性存在疑问，建议咨询专业的法律顾问。
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文章来源参考：头条-国有土地上房屋拆迁土地使用权补偿，国有土地征收协议有效吗为什么内容审核：石有成律师
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