处理土地纠纷确权证，可按以下步骤进行：
1.收集材料：当事人需收集与土地相关的各类资料，如土地承包合同、土地使用的历史凭证、村委会证明等，这些材料是证明土地权益的重要依据。
2.协商解决：双方当事人可自行协商，就土地纠纷的核心问题，如土地边界、使用权限等进行沟通，尝试达成一致协议。若达成协议，可共同到相关部门办理权证变更或确认手续。
3.申请调解：若协商无果，可向当地的农村土地承包仲裁机构或乡镇政府申请调解。调解机构会依据事实和法律规定进行调解，促使双方达成和解。
4.行政处理：若调解不成，可向县级以上人民政府土地管理部门提出行政处理申请。政府部门会进行调查和处理，作出行政裁决。
5.提起诉讼：当事人对行政处理决定不服的，可在规定时间内向人民法院提起行政诉讼，由法院进行审理和判决。
在整个处理过程中，要确保提供的材料真实有效，按规定的程序和要求进行操作。
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文章来源参考：头条-土地确权有纠纷的怎样写材料，土地纠纷土地确权证有用吗内容审核：毕文芳律师
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