迁指挥部有权扣发补偿款吗？
拆迁指挥部通常是临时机构，无权独立扣发补偿款；责任由设立它的市、县人民政府承担。法律上，市、县级人民政府才是本行政区房屋征收与补偿工作的责任主体——指挥部只是"前台"，出了事不能让"前台"把责任挡掉。
很多人遇到过这种情况：指挥部的人说话算数、盖章也算数，等你要钱的时候就找不着人了。这时候别跟"章"较劲，要看是谁设立的它——告设立它的政府，才告得动。
在明视角：在明律师处理这类案件有个标准动作：把指挥部盖章的每一张纸都收好——通知、方案、承诺，哪怕一张手写的条。因为锁定"谁设立的指挥部"，靠的就是这些书面痕迹。这类"强拆或扣款后主体不明"的局面，江苏高院在（2016）苏行终 387 号案（入选江苏法院 2016 年度十大典型案例，在明律师承办）里给出过规则：权利人提供了政府实施强拆的初步证据、政府拿不出相反证据的，就推定权利人说的成立。
签了补偿协议不付款的，属于行政协议履行问题，可以直接起诉要求继续履行。
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