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农村宅基地有房产证的情况下，拆迁时是有补偿的。以下是对这一问题的详细分析：
一、法律依据
根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，国家为了公共利益的需要，可以依法对土地实行征收或者征用并给予补偿。宅基地作为农村集体土地的一部分，当因公共利益需要被征收时，宅基地使用权人应当获得相应的补偿。同时，虽然《国有土地上房屋征收与补偿条例》主要针对国有土地上的房屋，但其中规定的公平补偿原则，同样适用于农村宅基地房屋的征收补偿，体现了法律对被征收人权益的保障。
二、补偿内容
1. 宅基地补偿：
宅基地补偿是对宅基地使用权价值的补偿，考虑因素包括宅基地的面积、地理位置、当地土地市场价值等。
补偿方式可能包括货币补偿，即根据当地征地补偿标准，评估宅基地使用权价值后按一定金额进行补偿；或者重新安排宅基地，即在符合土地利用总体规划和村庄规划的前提下，为被拆迁人重新分配一块合适的宅基地用于建房。
2. 地上房屋补偿：
地上房屋补偿是针对宅基地上合法建造的房屋进行的补偿。
补偿方式可能包括货币补偿，即综合考虑房屋的重置成新价和区位补偿价进行评估后给予补偿；或者产权调换，即拆迁方提供用于产权调换的房屋，与被拆迁房屋进行置换。
即使房屋无单独产权证书，但基于合法的宅基地使用许可，其建造通常具有合法性，因此也应获得相应补偿。
3. 其他相关损失补偿：
除了宅基地和地上房屋的补偿外，拆迁还可能涉及搬迁费用、临时安置费用等其他相关损失的补偿。
这些补偿旨在确保被拆迁人在拆迁过程中的基本生活不受影响，并帮助其顺利过渡到新的居住环境。
三、特殊情况说明
违法建筑：如果宅基地上的房屋属于违法建筑（如无相关审批手续擅自搭建），那么在拆迁时可能无法获得全额补偿，甚至可能面临被强制拆除的风险。
历史遗留问题：对于某些因历史原因未办理宅基地使用证或房产证但长期实际使用的宅基地和房屋，在拆迁时也可能根据实际情况给予一定的补偿，但这需要具体情况具体分析，并可能需要提供相关证明材料。
四、补偿方式的多样性
货币补偿：以现金的形式直接支付给被拆迁人，用于其自行购买住房或其他用途。
产权调换：提供安置房给被拆迁人，以同等价值的房屋置换被拆迁的房屋及宅基地权益。
结合型补偿：结合货币补偿和产权调换两种方式，既提供一部分安置房，又给予一部分货币补偿，以满足被拆迁人的多样化需求。
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内容来源参考：法律头条-有宅基地使用证拆了有没有补偿,农村拆迁宅基地有补偿吗
内容审核：范文玲律师
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