发生了拆迁安置协议纠纷的处理办法如下：
1.对于拆迁决定或者拆迁补偿安置裁决不服提起的诉讼，在性质上属于对行政机关的具体行政行为不服提起的行政诉讼，人民法院应当作为行政案件受理。
2.对于当事人达不成拆迁补偿安置协议，向人民法院提起民事诉讼后，人民法院不予受理，告知当事人可以依法向有关行政部门申请行政裁决。
3.当事人之间达成拆迁补偿安置协议后，一方不履行协议或者履行协议不适当的，当事人依拆迁补偿安置协议提起民事诉讼的，人民法院应当受理。
4.对于拆迁人与被拆迁人之间未达成拆迁补偿安置协议，未经行政裁决，而强行将被拆迁人的房屋拆除的，当事人以侵权为由向人民法院起诉的，人民法院应当作为民事案件受理。
法律依据：
《国有土地上房屋征收与补偿条例》第二十六条
房屋征收部门与被征收人在征收补偿方案确定的签约期限内达不成补偿协议，或者被征收房屋所有权人不明确的，由房屋征收部门报请作出房屋征收决定的市、县级人民政府依照本条例的规定，按照征收补偿方案作出补偿决定，并在房屋征收范围内予以公告。
补偿决定应当公平，包括本条例第二十五条第一款规定的有关补偿协议的事项。被征收人对补偿决定不服的，可以依法申请行政复议，也可以依法提起行政诉讼。
拆迁补偿安置协议的主要内容1.拆迁补偿方式，货币补偿金额及其支付期限;
2.安置用房面积、标准和地点;
3.产权调换房屋的差价支付方式和期限;
4.搬迁期限、搬迁过渡方式和过渡期限;
5.搬迁补助费和临时安置补助费或停产停业损失费发放标准和支付方式;
6.违约责任和争议解决的方式;
7.当事人约定的其他条款。
拆迁安置协议行政诉讼流程怎样在明网提醒您，拆迁安置协议行政诉讼的流程如下所示：
1.起诉状，这要包含原被告的基本信息、行政诉讼的事实和理由以及诉讼的请求，更为重要的是要提供相关的证据材料；
2.到法院立案，并缴纳相应的诉讼费用；
3.将缴费票据与材料交给法院立案庭，等通知。
4.法院立案后排期开庭，并将诉状副本、证据及其他材料送达给被告，送达被告后，会通知开庭时间，或邮寄开庭传票；
5.如果调解不成则开庭，开庭时还无法调解的，就会判决，最终发《行政判决书》。
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文章来源参考：头条-拆迁安置协议有法律效力吗，拆迁安置协议可以解除吗内容审核：邓青锋律师
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