房屋未经登记征收时，需根据具体情况处理。
1. 若房屋虽未登记，但确属被征收人的合法财产，征收部门应依据相关法律法规进行补偿。被征收人可提供相关证据，如购房合同、宅基地使用证等，以证明房屋的合法性及自身的所有权。
2. 对于历史遗留问题导致房屋未登记的情况，应通过合法程序进行认定和处理。例如，向相关部门申请历史遗留房屋认定，按照规定的程序和标准进行审核和确认。
3. 如果征收部门以房屋未登记为由拒绝补偿或不合理补偿，被征收人有权通过法律途径维护自身合法权益。可以向上级主管部门申请行政复议，或向人民法院提起行政诉讼，要求征收部门依法进行补偿。
总之，在房屋未经登记征收的情况下，被征收人应积极采取措施，维护自身合法权益。
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文章来源参考：头条-未经登记房屋认定办法，房屋未经登记征收怎么办手续内容审核：杨海军律师
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