在征收房屋过程中遇到有违建的情况，通常会按照以下方式处理：
1.认定违建：相关部门会依据法律法规和相关标准，对被征收房屋中的违建部分进行认定。这需要对房屋的建设情况进行详细调查和评估，确定其是否符合规划和建设要求。
2.依法处理：如果认定为违建，一般会根据违法的性质和程度，依法采取相应的处理措施，如责令拆除、罚款等。在处理违建过程中，会保障被征收人的合法权益，确保程序合法、公正。
3.补偿与违建的关系：对于合法建筑部分，会按照相关规定给予合理的补偿。而对于违建部分，通常不予补偿。但在一些特殊情况下，如因历史原因形成的违建等，可能会根据具体情况进行适当处理。
总之，在征收房屋过程中处理违建问题需要依法进行，既要维护公共利益和城市规划的严肃性，也要保障被征收人的合法权益。
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文章来源参考：头条-拆迁违建怎么补偿，征收房屋有违建怎么办手续内容审核：塔娜律师
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