土地确权发生纠纷可按以下步骤处理：
1.协商解决。纠纷当事人自行商量，在互谅互让的基础上达成一致，签订协议，解决纠纷。此方式能节省时间和成本，维护双方关系。
2.调解解决。若协商不成，可请求村民委员会、乡（镇）人民政府等进行调解。调解遵循自愿、合法原则，由第三方从中斡旋，提出解决方案，促使双方达成调解协议。
3.仲裁解决。达成仲裁协议的，可将纠纷提交农村土地承包仲裁机构仲裁。仲裁具有专业性、高效性特点，仲裁裁决对双方具有约束力。
4.诉讼解决。当事人不愿协商、调解或协商、调解不成，又未达成仲裁协议的，可向人民法院起诉。由法院依据事实和法律作出判决。
处理纠纷时，当事人需提供相关证据，如土地权属证书、承包合同、证人证言等，以支持自己的主张。
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文章来源参考：头条-土地确权纠纷法院受理吗，土地确权发生纠纷怎么办手续内容审核：高志鹏律师
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