公司征用农民土地，补偿款处理需遵循相关法律和规定。
首先，补偿款的发放主体通常是公司，但需经过合法流程。公司应将补偿款支付给负责征地的政府部门或相关机构，再由其按照规定分配给农民。若公司直接与农民协商征地，应在达成协议后，将补偿款直接支付给农民。
对于补偿款的分配，若土地为家庭承包经营，补偿款应发放给承包户。若涉及集体土地，补偿款中的土地补偿费归农村集体经济组织所有。集体经济组织可通过民主议定程序，决定在本集体经济组织内部分配土地补偿费。地上附着物及青苗补偿费归其所有者所有，如青苗是农民种植的，该部分补偿就应给农民。
农民若对补偿款的数额、发放等有异议，可与公司、政府部门沟通协商。协商不成，可通过行政复议或向法院提起诉讼等途径解决。同时，相关部门和公司应确保补偿款的发放公开透明，接受监督，保障农民合法权益。
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文章来源参考：头条-企业单位征用农村土地补偿，公司征地农民该如何补偿内容审核：刘鑫律师
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