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水库承包淹没区的处理需依法进行，主要涉及产权明确、征收程序、补偿标准、土地利用规划、生态环境保护及移民安置等方面。
1. 产权明确与使用权界定：明确被淹没土地的产权和使用权归属，包括土地所有者及土地使用权合同情况，为后续处理奠定基础。
2. 征收程序与补偿标准：
征收程序：政府应按法定程序发布土地征收公告，进行现状调查，组织社会稳定风险评估，制定并公告征地补偿安置方案，落实补偿费用，签订协议后办理审批手续。
补偿标准：依据《土地管理法》，补偿涵盖土地补偿费、安置补助费、地上附着物和青苗补偿费。土地补偿费按被征收土地前三年平均年产值的一定倍数计算；安置补助费根据需要安置的农业人口数计算；地上附着物和青苗补偿费根据实际情况和当地规定给予相应补偿。
3. 土地利用规划与调整：制定包括选址、基础设施建设、产业发展等在内的移民安置规划，确保土地资源高效合理配置。同时，规划建设生态缓冲带、防护林带等，保护水库生态环境。
4. 生态环境保护：在水库建设过程中采取生态修复措施，减少施工破坏；建立自然保护区、生态廊道等保护生物多样性。加强水质监测和保护，防止水质恶化，保障水库的生态功能和水资源安全。
5. 移民安置与社区发展：采用集中安置、分散安置和后靠安置等多种方式，结合当地实际情况和移民意愿进行选择。结合当地资源优势，发展特色农业、乡村旅游业等，为移民提供就业机会和稳定收入来源。促进移民融入当地社区，加强社会管理和服务。
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内容来源参考：法律头条-水库泄洪淹农田怎么办,水库淹没区补偿标准
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