一般情况下，楼顶违建在拆迁时不予补偿。根据法律规定，违法建筑不受法律保护，违建的认定通常依据城乡规划法等相关法律。未取得建设工程规划许可证或者未按照建设工程规划许可证的规定进行建设的建筑，属于违建范畴。
楼顶违建多为未经合法审批搭建，存在一定安全隐患，且违反了城市规划管理秩序。在拆迁过程中，拆迁方会对建筑合法性进行调查和认定。对于认定为违建的楼顶建筑，不会给予拆迁补偿。
不过，如果当事人能够证明该楼顶建筑虽无完整审批手续，但有历史遗留等特殊合理原因，可尝试与拆迁方沟通协商，提供相关证明材料，争取适当补偿。但这种情况下给予补偿并非普遍情形，最终结果需结合具体事实和证据确定。
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文章来源参考：头条-顶楼违建强拆人不在怎么办，拆迁楼顶搭棚会赔钱吗内容审核：付红英律师
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