耕地上建的厂房拆迁是否有补偿，需分情况判断。
若厂房建设合法，经过合法审批流程，取得了相关规划、用地等审批手续，符合耕地转为建设用地的法定程序，那么拆迁时应按照相关规定给予补偿，补偿通常涵盖房屋价值补偿、搬迁安置补偿、停产停业损失补偿等。
若厂房属于违法建筑，未获得合法审批，擅自改变耕地用途建设厂房，依据相关法律规定，这种建筑可能会被认定为违建。在拆迁时，一般不予补偿。不过，在实际操作中，若厂房建设存在历史原因或当地政策因素等，相关部门可能会根据具体情况给予适当的材料残值补偿等。
若对厂房合法性及补偿问题存在争议，当事人可通过查阅审批文件、咨询相关部门等方式确定厂房性质，也可考虑通过法律途径维护自身权益。
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文章来源参考：头条-耕地建厂房算不算违建，耕地上建的厂房拆迁有补偿吗怎么算内容审核：赵帅律师
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