土地征收补偿纠纷案由主要包括以下几种：
1. 土地征收补偿费用分配纠纷，即因土地征收补偿费用在相关主体之间的分配问题而引发的纠纷，如村集体组织成员之间对补偿款的分配争议。
2. 土地征收补偿协议纠纷，主要涉及土地征收部门与被征收人之间在补偿协议的签订、履行等过程中产生的纠纷，比如协议的条款约定不明、一方违约等情况。
3. 土地征收程序违法纠纷，当土地征收过程中存在违反法定程序的行为，如未依法公告、未进行听证等，被征收人由此引发的纠纷。
4. 土地征收补偿标准纠纷，即对土地征收补偿的标准合理性存在争议，包括补偿标准过低或过高等情况引发的纠纷。
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文章来源参考：头条-土地征收补偿纠纷，土地征收补偿纠纷案由有哪些内容内容审核：卢恩光律师
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