土地使用权纠纷判定需依据相关法律法规和具体事实情况。
判定纠纷要先确定土地性质，分清是国有土地还是集体土地。国有土地使用权纠纷通常根据《土地管理法》《城市房地产管理法》等规定处理；集体土地使用权纠纷则依据《农村土地承包法》等相关法律。
若纠纷涉及土地权属争议，由当事人协商解决；协商不成的，由人民政府处理。单位之间的争议，由县级以上人民政府处理；个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起一定期限内，向人民法院起诉。
在判定时，会审查双方的证据材料，如土地使用证、承包合同、转让协议等，以确定土地使用的合法性和权益归属。对于历史遗留问题造成的纠纷，会结合当时的政策和实际使用情况进行综合判断。同时，考虑土地的使用现状和合理利用原则，保障土地资源的有效配置和合法使用。
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文章来源参考：头条-土地使用权争议相关法律规定，土地使用权纠纷如何处理内容审核：李如律师
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