农村两层房屋拆迁赔偿通常有以下几种方式及计算依据：
货币补偿
根据被拆迁房屋的区位、用途、建筑面积等因素，以房地产市场评估价格确定。一般会考虑房屋的重置成新价，即重新建造同等结构、面积、质量房屋所需要的成本，再结合房屋的折旧等情况进行评估。此外，还会有宅基地的区位补偿价，不同地区的宅基地价值不同，会综合当地的经济发展水平、土地供求关系等确定。
产权置换
拆迁方会提供安置房屋，按照一定的置换比例进行补偿。例如，可能按照1:1.2或1:1.5等比例，用被拆迁房屋面积置换安置房面积。如果置换的房屋面积超过原房屋面积，被拆迁人可能需要按照一定价格补差价；若小于原房屋面积，拆迁方应给予相应货币补偿。
另行审批宅基地建房
这种情况下，拆迁方会另外安排宅基地供被拆迁人重新建房，同时对被拆除的房屋给予重置成新价补偿，用于被拆迁人在新宅基地上建造房屋。
各地的农村拆迁赔偿标准差异较大，具体赔偿方式和金额应以当地政府制定的拆迁补偿方案为准。被拆迁人对补偿有异议时，可通过合法途径维护自身权益。
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文章来源参考：头条-农村二层楼拆迁，农村拆迁两层楼内容审核：张作元律师
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