法院判决土地纠纷案，会依据相关法律规定和具体案件事实。
首先，法院会审查土地的权属证明。若有合法有效的土地权属证书，这通常是认定土地归属的关键依据。若一方能提供清晰、合法的权属证书，法院倾向于支持其对土地的权利主张。
其次，会考虑土地的使用情况。长期、连续且合理地使用土地的一方，其权益会得到一定程度的保护。比如一方在争议土地上进行了种植、建设等行为，且没有违反法律法规，法院在判决时会予以考量。
再者，若存在土地流转等情况，法院会审查流转合同的效力。合法有效的流转合同对土地权益的转移有重要影响。若流转合同符合法律规定的形式和实质要件，法院会认可其效力。
此外，法院还会综合考虑历史因素、公平原则等。对于一些因历史原因导致的土地纠纷，会结合当时的政策和实际情况进行判断。同时，在判决时尽量保障双方当事人的合法权益，遵循公平原则。
总之，法院会全面审查证据和事实，依据相关法律规定作出公正的判决。
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文章来源参考：头条-土地纠纷经典案例，土地纠纷案怎么处理内容审核：王天子律师
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