自建房若被认定为违建，在征收时的补偿情况需分情况讨论：
一是对于取得相关建设规划许可等合法手续，但因历史遗留问题等导致手续不全，被认定为违建的。若符合一定的政策条件，可能会给予适当补偿。相关部门一般会综合考虑房屋建造时间、当时的政策背景、当事人是否存在主观过错等因素，按照合理标准予以补偿，以保障当事人的合法权益。
二是对于未取得任何合法手续，且不符合相关规划要求，属于严重违建的情况。通常情况下，这类违建在征收时可能不会获得补偿。因为违建本身违反了法律法规，不受法律保护。政府征收是基于公共利益的需要，对于违法建筑不应予以支持和补偿。
总之，自建房违建征收补偿问题较为复杂，具体补偿与否及补偿标准需根据实际情况，由相关部门依法依规进行认定和处理。当事人若对认定结果或补偿决定不服，可通过合法途径，如行政复议、行政诉讼等维护自身权益。
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文章来源参考：头条-违规自建房处罚标准，自建房违建征收补偿方案内容审核：尹利兵律师
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