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农村违建强拆房屋的管理主要归县级以上地方人民政府城乡规划主管部门负责。以下是详细解析：
主要管理部门：
根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》第二十四条，市、县级人民政府及其有关部门应当依法加强对建设活动的监督管理，对违反城乡规划进行建设的，依法予以处理。这意味着，市、县级人民政府在发现农村的违建情况时，有权依法进行强拆。
《中华人民共和国土地管理法》第七十四条也明确规定了，对于违反土地利用总体规划的行为，县级以上人民政府自然资源主管部门有权进行管理，包括限期拆除在非法转让的土地上新建的建筑物和其他设施。
协管部门与流程：
在实际执行过程中，除了主要的城乡规划主管部门，可能还会有其他相关部门如房屋土地管理局、规划局等参与管理。例如，房屋土地管理局可能在房屋征收、补偿等方面发挥作用，而规划局则可能在规划许可和违规认定方面提供帮助。
违建房屋强拆的程序通常包括立案（接到投诉或举报后决定查处）、调查程序（调查人员出示执法证件进行现场调查）、以及决定程序（根据调查结果作出行政处罚决定，包括强拆等）。
法律依据：
《国有土地上房屋征收与补偿条例》和《中华人民共和国土地管理法》都明确规定了政府部门在违建管理方面的职责和权力，是农村违建强拆房屋管理的主要法律依据。
综上所述，农村违建强拆房屋的管理主要由县级以上地方人民政府城乡规划主管部门负责，但也可能有其他相关部门的参与和协作。在实际执行过程中，应严格按照相关法律法规的规定和程序进行操作。
法律分析：
一般违建房屋会由县级以上的人民政府的行政管理部门执行强拆，国土资源管理局有权利查处违章建筑，同时也可以行使土地的使用权。
违章建筑首要应该下发具体的通知，责令修改或停止施工，但要注意执行强拆必须要由人民法院强制执行。
法律依据：
《中华人民共和国土地管理法》 第七十二条 县级以上人民政府自然资源主管部门在监督检查工作中发现土地违法行为构成犯罪的，应当将案件移送有关机关，依法追究刑事责任；
尚不构成犯罪的，应当依法给予行政处罚。
一、村里的违建谁有权拆除1、村里的违建乡、镇人民政府有权拆除。
乡镇人民政府发现正在建设的乡村违法建设后，应当立即书面责令停止建设，当事人不停止建设的，可以查封施工现场。
2、法律依据：
《中华人民共和国城乡规划法》第六十五条在乡、村庄规划区内未依法取得乡村建设规划许可证或者未按照乡村建设规划许可证的规定进行建设的，由乡、镇人民政府责令停止建设、限期改正；
逾期不改正的，可以拆除。
二、违建的认定标准是什么1、未申请或申请未获得批准，未取得建设用地规划许可证和建设工程规划许可证而建成的建筑；
2、擅自改变建设工程规划许可证的规定建成的建筑；
3、擅自改变了使用性质建成的建筑；
4、擅自将临时建筑设成为永久性建筑。
拆除违章建筑和超过批准期限的临时建筑不予补偿。
没规定无证房不予补偿。
如果对无证房未作任何结论就强制拆迁了，产生了要求赔偿损失的权利。
其中认定违章建筑应有法律文书，当事人不服的享有申辩、复议、诉讼等权利。
法律分析：
国家对于违建的处理并不是一棒子打死，全部拆除的，也是会根据现实的情况而定的，灵活性还比较高，不过如果千万别轻易试探法律，好好建房，按照规定申请、建房肯定是最保险的方式。
未取得建设工程规划许可证或者未按照建设工程规划许可证的规定进行建设的，责令停止建设，尚可采取改正措施消除对规划实施的影响的，限期改正并处罚款；
无法采取改正措施消除影响的，才可以限期拆除。
法律依据：
《城市市容和环境卫生管理条例》第三十七条 凡不符合城市容貌标准、环境卫生标准的建筑物或者设施，由城市人民政府市容环境卫生行政主管部门会同城市规划行政主管部门，责令有关单位和个人限期改造或者拆除；
逾期未改造或者未拆除的，经县级以上人民政府批准，由城市人民政府市容环境卫生行政主管部门或者城市规划行政主管部门组织强制拆除，并可处以罚款。
法律分析：
一般违建房屋会由县级以上的人民政府的行政管理部门执行强拆，国土资源管理局有权利查处违章建筑，同时也可以行使土地的使用权。
违章建筑首要应该下发具体的通知，责令修改或停止施工，但要注意执行强拆必须要由人民法院强制执行。
法律依据：
《中华人民共和国土地管理法》 第七十二条 县级以上人民政府自然资源主管部门在监督检查工作中发现土地违法行为构成犯罪的，应当将案件移送有关机关，依法追究刑事责任；
尚不构成犯罪的，应当依法给予行政处罚。
法律分析：
农村违建房归县级以上人民政府土地行政主管部门（国土资源局）、乡、镇人民政府管理。
擅自将农民集体所有的土地通过出让、转让使用权或者出租等方式用于非农业建设，或者违反本法规定，将集体经营性建设用地通过出让、出租等方式交由单位或者个人使用的，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令限期改正，没收违法所得，并处罚款。
法律依据：
《中华人民共和国土地管理法》 第八十三条 依照本法规定，责令限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施的，建设单位或者个人必须立即停止施工，自行拆除；
对继续施工的，作出处罚决定的机关有权制止。
建设单位或者个人对责令限期拆除的行政处罚决定不服的，可以在接到责令限期拆除决定之日起十五日内，向人民法院起诉；
期满不起诉又不自行拆除的，由作出处罚决定的机关依法申请人民法院强制执行，费用由违法者承担。
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文章来源参考：头条-灵会农村房屋违建谁管，农村违建房屋应该由哪个部门执行强拆？
内容审核：王子诚律师
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