拆迁补偿协议纠纷是行政诉讼，人民法院受理公民、法人或者其他组织提起的下列诉讼：对征收、征用决定及其补偿决定不服的；认为行政机关侵犯其他人身权、财产权等合法权益的。
《中华人民共和国行政诉讼法》第十一条
行政机关为实现公共利益或者行政管理目标，在法定职责范围内，与公民、法人或者其他组织协商订立的具有行政法上权利义务内容的协议，属于行政诉讼法第十二条第一款第十一项规定的行政协议。公民、法人或者其他组织就下列行政协议提起行政诉讼的，人民法院应当依法受理：
（一）政府特许经营协议；
（二）土地、房屋等征收征用补偿协议；
（三）其他行政协议。
拆迁补偿协议纠纷的诉讼时效在明网提醒您，拆迁补偿协议诉讼时效是六个月，自知道或者应当知道作出行政行为之日或被侵害之日起计算。当事人应当在诉讼时效范围内提出诉讼请求，超过20年的拆迁补偿款诉讼法院不予受理。
《行政诉讼法》第四十六条
公民、法人或者其他组织直接向人民法院提起诉讼的，应当自知道或者应当知道作出行政行为之日起六个月内提出。法律另有规定的除外。因不动产提起诉讼的案件自行政行为作出之日起超过二十年，其他案件自行政行为作出之日起超过五年提起诉讼的，人民法院不予受理。
拆迁补偿协议起诉的条件1.原告是认为具体行政行为侵犯其合法权益的公民、法人或者其他组织，即起诉人具有原告资格；
2.有明确的被告。原告起诉需明确指出作出具体行政行为的行政机关或法律、法规授权组织；
3.有具体的诉讼请求和事实根据；
4.属于人民法院受理行政诉讼的范围和受诉人民法院管辖。
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文章来源参考：头条-拆迁补偿协议属于什么性质，拆迁补偿协议是行政诉讼还是民事诉讼内容审核：尹虎律师
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