违章建筑的房屋根据房屋建设的时间来判定赔偿的方法。如果建设的房屋年代久远，在那个时候没有严格的产权制度的规定，多数都是一纸合同或是口头约定的房屋，根据各地的补偿标准，部分城市是可以获得全额补偿的。但违章建筑建设的时间较近的话，赔偿不能全额赔偿，要看各地的执行办法而定。若是在工程开始之初恶意建设房屋以求获得赔偿的房屋是没有赔偿的资格的。违章的建筑虽然没有房产证，但是政府也会考虑建设房屋的人的损失而予以一定的补偿，与正常的赔偿方法是不一样的。
1、有条件的，优先采取宅基地迁建安置，另补偿房屋重建成本价。
2、纯货币补偿，房屋重建成本价＋宅基地地价（各地有区位补偿价，当地政府网站或者国土部门网站可查询、了解）。
3、房屋置换，相同地段按照面积，拆多少补多少。
1、房屋的产权证是拆迁户主的名字的，可以直接登记赔偿事宜。政府按照相应的赔偿政策支付赔偿金。
2、只是拥有购房合同，而房屋的产权证不是自己的名字而是家人的名字，可以根据房屋产权的共有性平摊赔偿款。
3、拆迁房拥有购房合同，但是房屋的产权证不是使用房屋的个人或是家庭，而是房屋出售的原房主的话，因为产权没有变更，赔偿款就落在了原房主上。原房主愿意退还赔偿款的话就没有什么说法了。但是原房主根据产权说话不退换赔偿款的话，只能上诉法院。但是此类官司获胜的可能性很小。只能根据房屋的购房合同违约行为的规定解除合同，要求退还之前缴纳的全部房款以及赔偿。如果在合同内没有相关内容违约的处理办法，只能是依靠法律解决了。
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文章来源参考：头条-农村违建强拆房屋归什么部门管理，农村违章建筑拆除补偿标准内容审核：岳亭律师
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