双方可以协商处理。
该条款明确了土地承包经营权的公式对抗主义，登记对抗善意第三人。也就是说，双方对互换土地原享有的承包权利和承担的义务相应互换，当事人可以要求办理农村土地承包经营权证变更登记手续。不登记，不影响土地承包经营权的变更。但是在遇到征地后，没有到村委会办理变更手续的话，补偿款由原承包户获得。当然，如果办理了变更手续，补偿款就由变更后的权利人享有。
所以，为了完整的享受土地权利，互换土地承包经营权的农民们，一定要去村委会申请办理变更登记手续，以避免不必要的纠纷和损失。
土地互换的概念土地互换是指承包方之间为方便耕作或者各自需要，对属于同一集体经济组织的承包地块进行交换，同时交换相应的土地承包经营权。农村土地可以互换，但是要签订互换协议。农村土地承包经营权互换后，互换双方都要按互换协议执行。
土地互换会出现的问题互换从表面上看是地块的交换，但从性质上看，是由交换承包的土地引起的权利本身的交换。权利交换后，原有的发包方与承包方的关系，变为发包方与互换后的承包方的关系，双方的权利义务同时做出相应的调整。如果互换后的权属不明确，那么就会出现互换双方对权利的争夺和对义务的推脱等情况，不利于集体之间的和谐。
再者，由于承包地分布地区与地形不同，缺乏合适的测量工具，互换承包地常出现面积不等等问题。在征地拆迁的时候，为了得到更多利益述求。互换承包地获利较少或无获利的一方，往往会要求取得原承包地的征地补偿款。这时候，双方就会因谁是土地上的权利者，谁有权获得补偿款而产生纠纷。
土地互换需要谨慎，在这过程中双方要确定好各自的权利义务，意思要一致，也要学会维护自己的权益，以上就是在明网小编整理的关于换地协议签订后征地怎么办的相关内容，若有其他疑问欢迎咨询在明网律师。
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