被征收土地上存在违建的，一般会按照以下方式处理：
1. 调查认定：相关部门会对违建进行详细调查，确认违建的事实、范围和性质等。这包括对土地使用情况、建筑建设过程等方面的查证。
2. 依法处理：根据相关法律法规，对于违建通常会采取责令限期拆除、没收违法建筑物等措施。如果违建存在安全隐患等特殊情况，可能会要求立即拆除以保障公共安全。
3. 补偿影响：在征收过程中，违建部分一般不会给予补偿。但对于因违建被拆除而导致的合法财产损失，征收部门应依法给予合理补偿。例如，因拆除违建而对合法建筑造成的损坏等。同时，在处理违建时，也会保障当事人的合法权益，确保处理过程合法合规、公平公正。
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