1.村委会的确拥有对征地补偿款进行保留的权利，然而，这只限于部分款项，将所有补偿费用尽数保留显然是违法行为，对此，广大村民可依据相关法规进行权益维护。
据现行法律规定，土地补偿款应归属农村集体经济组织持有。
村委会作为村民自治组织，自然享有管理本村内属于村农民集体所有的土地及其他财产的权力，因此，土地补偿款在村委会处理村集体公共管理事务中占据了重要地位，可以予以适当保留。
至于其他款项的补偿费，则需专款专用，直接发放至被征地农民手中。
2.对于扣留土地补偿款的比例，国家并未作出统一规定，但从各省市自行制定的分配方案来看，扣留比例大致在10%-30%之间，通常不应超过30%。
关于被扣留的土地补偿款如何使用，同样受到严格限制。
依照国家法律规定，土地补偿款首先应用于村庄的公共设施建设或其他公益事业，具体用途需经由村民会议讨论决定。
《中华人民共和国土地管理法实施条例》第二十六条
需要征收土地，县级以上地方人民政府认为符合《土地管理法》第四十五条规定的，应当发布征收土地预公告，并开展拟征收土地现状调查和社会稳定风险评估。
征收土地预公告应当包括征收范围、征收目的、开展土地现状调查的安排等内容。征收土地预公告应当采用有利于社会公众知晓的方式，在拟征收土地所在的乡（镇）和村、村民小组范围内发布，预公告时间不少于十个工作日。自征收土地预公告发布之日起，任何单位和个人不得在拟征收范围内抢栽抢建；违反规定抢栽抢建的，对抢栽抢建部分不予补偿。
土地现状调查应当查明土地的位置、权属、地类、面积，以及农村村民住宅、其他地上附着物和青苗等的权属、种类、数量等情况。
社会稳定风险评估应当对征收土地的社会稳定风险状况进行综合研判，确定风险点，提出风险防范措施和处置预案。社会稳定风险评估应当有被征地的农村集体经济组织及其成员、村民委员会和其他利害关系人参加，评估结果是申请征收土地的重要依据。
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