法院判决农村土地纠纷，会依据事实、证据和相关法律规定。
首先，会审查土地权属证明。若双方有合法有效的土地承包经营权证、宅基地使用证等权属凭证，法院通常以此为重要依据判定土地归属。例如，一方持有政府颁发的土地承包经营权证，且四至清晰，在承包期限内，其合法权益会得到法院保护。
其次，考虑土地使用的历史和现状。如果存在长期使用的事实，法院会综合考量。比如，某农户连续多年耕种某块土地，且其他村民未提出异议，在判定时会予以参考。
再者，遵循法律和政策规定。《土地管理法》《农村土地承包法》等是主要的裁判依据。若纠纷涉及土地流转，法院会审查流转是否符合法定程序和条件。
另外，对于争议土地上的附属物、农作物等，法院会根据公平原则和实际情况处理。若一方在土地上种植了农作物，在判决土地归属时，会考虑对农作物的合理补偿。
最后，若纠纷涉及行政机关的处理决定，法院会审查行政行为的合法性。如政府对土地权属作出了处理，法院会判断该处理是否符合法定程序和实体规定。
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文章来源参考：头条-农村土地纠纷打官司要在什么法院，农村土地纠纷法院判决书查询内容审核：冯振兴律师
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