土地确权发现纠纷，可按以下步骤处理：
第一，协商解决。发生纠纷后，当事人应在自愿、互谅基础上，依据法律规定直接进行磋商，自行解决争议。这是最基本、最常见的方式，成本低且有利于维护双方关系。
第二，调解解决。若协商不成，可请求有关机构调解。如当事人可要求村民委员会、乡（镇）人民政府等调解。这些调解机构具备专业知识和调解经验，能公正地进行调解。
第三，行政处理。个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理；单位之间的争议，由县级以上人民政府处理。当事人对处理决定不服的，可自接到处理决定通知之日起一定期限内，向人民法院起诉。
第四，诉讼解决。当事人也可不经以上程序，直接向人民法院提起民事诉讼，但需符合起诉条件。在整个处理过程中，当事人应注意收集和保存相关证据，如土地权属证明、承包合同等，以维护自身合法权益。
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文章来源参考：头条-土地确权有争议应找哪个部门解决，土地确权后有纠纷的怎样解决问题内容审核：铁慧芳律师
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