村上征收承包地时遇到有树木的情况，一般应按照以下方式处理。
1. 对树木进行评估：由专业的评估机构对树木的价值进行评估，包括树木的品种、规格、生长状况等因素，以确定其合理的补偿价格。
2. 协商补偿事宜：村上应与承包方就树木的补偿问题进行协商，根据评估结果确定补偿金额，并达成书面协议。协商过程中，应充分考虑承包方的合法权益，确保补偿公平合理。
3. 办理相关手续：在确定补偿事宜后，村上应协助承包方办理树木的砍伐、迁移等相关手续，确保征收工作的顺利进行。同时，应遵守相关法律法规，如《森林法》等，保障树木的合法权益。
总之，村上在征收承包地时，应妥善处理树木问题，保障承包方的合法权益，确保征收工作的合法合规。
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文章来源参考：头条-2020农村土地征收树木补偿新标准，村民承包地被征收内容审核：李小乐律师
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